27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3040 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  48.57 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  47.15 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  47.37 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  42.75 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  43.59 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  42.95 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  42.36 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  32.21 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  38.06 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  38.13 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  41.51 
 
 		 351 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  39.33 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  29.34 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  28.89 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  33.77 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  31.1 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  30 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  31.3 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  32.54 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  30.57 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  28.57 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>