159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1183 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  26.7 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  30.33 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  29.38 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  26.01 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  35.51 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  33.07 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.78 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  30 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  36.97 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  32.18 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  38.04 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  31.4 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  27.09 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  38.46 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.17 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  25.88 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  27.57 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  28.87 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.72 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  26.17 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  26.17 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  28.12 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  29.06 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  30.82 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  26.17 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.48 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  28.43 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  26.39 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  26.54 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  25.84 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.16 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  28.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  36.63 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0978  putative phage repressor  43.75 
 
 		 105 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  24.2 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  35.34 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.57 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  35.34 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  35.34 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  35.34 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  23.61 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  31.07 
 
 		 120 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  28.19 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.84 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  31.54 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  35.48 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.19 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.2 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  25 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30.95 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  26.85 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  32.32 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  39.6 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  33.05 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  26.16 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  28.66 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.07 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  25.91 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  29.77 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  33.62 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  40.82 
 
 		 1418 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  45.31 
 
 		 133 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  36.49 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.21 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  35.34 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  34.72 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  33.62 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  28.35 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  34.62 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  26.4 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  26.4 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  33.71 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  27.1 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  29.46 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  29.46 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  29.46 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  35.35 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  31.82 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18480  Peptidase S24-like protein  35.06 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.333432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.97 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  36.49 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  27.78 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  44.12 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.87 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  29.13 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  31.51 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  36.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>