28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2711 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  39.19 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  39.06 
 
 
206 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
72 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  40.68 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  30.43 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  38.98 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  40.38 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  41.67 
 
 
141 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>