87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0155 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2300  XRE family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4676  normal  0.0781395 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  44.29 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  45 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  34.85 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  46.03 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  46.03 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  46.03 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  34.78 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  46.03 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  46.03 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  34.78 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  46.03 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  33.9 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  46.03 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  42.42 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30.3 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.89 
 
 		 509 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  45.9 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.98 
 
 		 517 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 88 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 180 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 72 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 92 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 88 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 236 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  35.71 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  32.81 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 224 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  32.81 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 304 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  39.62 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  39.62 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 88 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>