39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0718 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  51.13 
 
 		 229 aa  218  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  50.68 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  47.58 
 
 		 275 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  50.23 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 246 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  47.01 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  46.46 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  47.71 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  42.48 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  42.98 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  41.85 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  44.98 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  41.23 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  42.92 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  42.54 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  43.11 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  39.82 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  42.51 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 67 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  32.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1211  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 71 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 134 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 183 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 141 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 490 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 100 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>