28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0552 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  72.76 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  50.66 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  51.3 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  52.4 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  47.79 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  46.49 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  46.49 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  42.92 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  46.02 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  40.51 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  41.48 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  37.92 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  35.47 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  34.42 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>