31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0689 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 242 aa  417  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  79.75 
 
 		 237 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  81.28 
 
 		 239 aa  380  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  52.34 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  56.61 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 246 aa  191  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  43.11 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  41.28 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  41.28 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  41.03 
 
 		 275 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  40.97 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  39.38 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  39.21 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  36.6 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0013  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 402 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 91 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 329 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>