28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0721 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
236 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  85.17 
 
 
236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  72.93 
 
 
233 aa  341  5e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  67.7 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  62.61 
 
 
236 aa  299  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  46.96 
 
 
236 aa  209  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
236 aa  208  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  46.02 
 
 
236 aa  205  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  49.77 
 
 
239 aa  202  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  44.74 
 
 
236 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
246 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  43.36 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  42.54 
 
 
224 aa  169  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  38.94 
 
 
229 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 
229 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  38.94 
 
 
229 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  40.89 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.26 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
237 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  36.24 
 
 
275 aa  152  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  38.39 
 
 
242 aa  150  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  37.39 
 
 
239 aa  149  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.13 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 
241 aa  142  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  33.05 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.475219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>