27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1971 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  75.98 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  72.93 
 
 		 236 aa  341  5e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  72.49 
 
 		 235 aa  337  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  69.96 
 
 		 236 aa  318  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  44.59 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  41.74 
 
 		 236 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  41.23 
 
 		 224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  36.86 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.92 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  35.22 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>