27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2767 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  67.52 
 
 		 235 aa  320  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  69.96 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  65.65 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  62.61 
 
 		 236 aa  299  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  43.23 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  43.36 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  41.48 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  41.74 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  39.57 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  39.57 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  39.91 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  39.82 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.07 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  38.95 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>