27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2360 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  76.27 
 
 		 236 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  70.76 
 
 		 236 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 236 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  63.56 
 
 		 236 aa  322  4e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 246 aa  248  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  46.96 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  46.96 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  44.3 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  44.3 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  43.86 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  46.46 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  41.88 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  37.45 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  41.35 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  39.83 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  33.19 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>