33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1389 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1389  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1931  XRE family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.380591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0552  XRE family transcriptional regulator  51.29 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0152  XRE family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0158  helix-turn-helix domain-containing protein  50.66 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1628  XRE family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2056  transcriptional regulator, XRE family  52.58 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2360  helix-turn-helix domain-containing protein  48.47 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2511  transcriptional regulator, XRE family  47.11 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122746  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  48.9 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1971  transcriptional regulator, XRE family  49.07 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0813704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0721  transcriptional regulator, XRE family  48.66 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  45.58 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0457  helix-turn-helix domain-containing protein  46.93 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0525  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1462  XRE family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0380  helix-turn-helix domain-containing protein  46.49 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2767  transcriptional regulator, XRE family  44.54 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0019  helix-turn-helix domain-containing protein  43.56 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0689  XRE family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  41.56 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  41.36 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1149  helix-turn-helix domain-containing protein  38.94 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.475219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1363  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 169 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 67 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.97 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  27.84 
 
 		 348 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  27.84 
 
 		 347 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>