237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  92.24 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  59.09 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  57.93 
 
 		 334 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  58.79 
 
 		 340 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  56.23 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  52.57 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  63 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  63.98 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  33.04 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  28.07 
 
 		 393 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  29.73 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  31.85 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  32.84 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  32.14 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  33.24 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  29.48 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  29.63 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  30.31 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.05 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  25.45 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.99 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.99 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.99 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.99 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.99 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  28.99 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  30.59 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  29.51 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  28.7 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  29.1 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  29.82 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  30.97 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  29.45 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  26.61 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  27.87 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  31.02 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  29.59 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  29.5 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  27.2 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  26.99 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  25.99 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  27.07 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  27.07 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.99 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  24.59 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  25.6 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.06 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  29.94 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.35 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.11 
 
 		 300 aa  86.3  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.3 
 
 		 321 aa  86.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  28.66 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  40 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  42.86 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  25.78 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  35.77 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  23.56 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.06 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  41.1 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.51 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  27.3 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  26.02 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  23.53 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  42.86 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  42.86 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  41.89 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  26.92 
 
 		 293 aa  67  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  28.26 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  33.62 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  42.86 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  42.86 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  42.86 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  30.22 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  43.04 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  34.52 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  26.06 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.3 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  32.76 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  44.93 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  35.14 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  23.9 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  29.84 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>