159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0287 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  796    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  46.4 
 
 		 323 aa  285  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  47.49 
 
 		 321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  37.98 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  36.22 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  36.96 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  35.07 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  34.01 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  33.79 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  33.15 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  33.7 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  33.24 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  33.42 
 
 		 334 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  34.7 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  33.7 
 
 		 334 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  34.97 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  29.78 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  34.97 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  34.97 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  34.97 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  34.97 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  34.97 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  33.6 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  34.7 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  29.62 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  32.97 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  34.19 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  31.48 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  34.19 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  32.41 
 
 		 321 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  32.65 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  32.36 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  32.7 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  30.75 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  32.43 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  30.11 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  29.97 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  31.89 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  31.89 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  29.43 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.34 
 
 		 374 aa  140  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 345 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  31.17 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  30.33 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  27.63 
 
 		 361 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  30.65 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  27.61 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  28.37 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  25.5 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  28.49 
 
 		 340 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  26.88 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  25.73 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  25.29 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  25.98 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  25.98 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  49.33 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  29.8 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  26 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  37.23 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 314 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25.07 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.29 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  29.45 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  35.96 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  29.25 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  36.08 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  26.18 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  28.1 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  28.1 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  29.25 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  38.75 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  36.11 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  27.78 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  23.53 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  35.71 
 
 		 565 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  24.48 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  29.63 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  31.58 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  31.33 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>