187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1502 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  99.47 
 
 
189 aa  390  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  26.42 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  26.42 
 
 
263 aa  72  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.42 
 
 
374 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30.5 
 
 
352 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  30.83 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  31.01 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  27.22 
 
 
321 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  31.09 
 
 
380 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  40.51 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  28.3 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  31.09 
 
 
375 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  45.31 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  29.69 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  45.31 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  45.31 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  30.07 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  45.31 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  45.31 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  45.31 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  26.81 
 
 
436 aa  65.1  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.16 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  45.31 
 
 
336 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  45.31 
 
 
336 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  26.06 
 
 
287 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  64.3  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  26.19 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
369 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  26.19 
 
 
356 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  28.1 
 
 
393 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.19 
 
 
356 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.88 
 
 
323 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  29.46 
 
 
248 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
339 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
339 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  26.54 
 
 
350 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.95 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
334 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
334 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
338 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
338 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
260 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
351 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  37.35 
 
 
342 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  31.25 
 
 
281 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  30.67 
 
 
330 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  30.14 
 
 
327 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  26.67 
 
 
321 aa  61.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
342 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  34.52 
 
 
291 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  40.85 
 
 
347 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  40.85 
 
 
348 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.35 
 
 
323 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 
329 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  28.23 
 
 
296 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
370 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  27.87 
 
 
334 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
345 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  36.11 
 
 
273 aa  58.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  36.11 
 
 
338 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.83 
 
 
293 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  29.17 
 
 
368 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  43.55 
 
 
314 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  27 
 
 
345 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 
343 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
325 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
362 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  29.17 
 
 
363 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  31.18 
 
 
340 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  24.17 
 
 
380 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  24.84 
 
 
364 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  30.88 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  36.62 
 
 
335 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  34.94 
 
 
331 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  29.86 
 
 
334 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  27.52 
 
 
271 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  29.86 
 
 
334 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
345 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  29.86 
 
 
336 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 
340 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  29.86 
 
 
334 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  27.32 
 
 
332 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  29.86 
 
 
334 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  35.62 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  32.31 
 
 
324 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  26.92 
 
 
310 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  29.25 
 
 
336 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  26.83 
 
 
267 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.47 
 
 
337 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
344 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  28.17 
 
 
273 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.05 
 
 
314 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  22.01 
 
 
340 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  36.76 
 
 
300 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>