143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02982 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  718    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  29.62 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  33.83 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  29.61 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  30.63 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  29.86 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  30.17 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  28.9 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  29.26 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  29.14 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  28.61 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  29.14 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  28.72 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  32.54 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  29.1 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.78 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  29.24 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  26.8 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  27.96 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  27.82 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  28 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  27.79 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  27.32 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  24.59 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  24.62 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  26.85 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  26.12 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  25.62 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  25.92 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  25.92 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  26.18 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  26.05 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  26.24 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  26.18 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  26.18 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  26.18 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  26.18 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  26.18 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  25.92 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.6 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  25.07 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25.29 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  24.85 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  22.03 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  22.87 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  22.43 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  22.63 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  37.93 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  35.14 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  21.08 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  21.85 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.85 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  27.91 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  26.54 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  26.54 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  36.76 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  36.76 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  27.91 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.62 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.15 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  37.5 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  26.83 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  24.06 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  24.86 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  21.79 
 
 		 311 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  30.26 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  24.47 
 
 		 277 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  34.29 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25.81 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  23.64 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  35.14 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  25.58 
 
 		 566 aa  49.7  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  28.99 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  35.21 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  23.08 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  33.82 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>