185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0955 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  692    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  29.43 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  42.31 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  31.65 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  39.17 
 
 		 285 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  47.62 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  43.84 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.36 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  36.84 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  40.85 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  31.86 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  38.37 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  32.89 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  30.06 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  35.62 
 
 		 266 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  32.86 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  26.24 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  42.03 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  26.55 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  43.24 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  31.78 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25.34 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  30.23 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.79 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  31.58 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  26.43 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  34.23 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  43.66 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  27.88 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  41.94 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.47 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  37.33 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  31.15 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  34.18 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  39.44 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  28.99 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  33.7 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  36.9 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.15 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  32.61 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  29.63 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  45.16 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  32.48 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  43.08 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  33.59 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  40.48 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.24 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  37.84 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  38.24 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.89 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  40.58 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  36.49 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  27.8 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  32.77 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  37.7 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  40 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  31.48 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  26.5 
 
 		 251 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  39.44 
 
 		 491 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 267 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  38.67 
 
 		 142 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  26.95 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  38.96 
 
 		 288 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  25.74 
 
 		 308 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  36.92 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0621  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.503342  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  30.12 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  24.38 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 285 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  38.57 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>