225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1837 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  95.86 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  95.86 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  86.55 
 
 		 342 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  82.32 
 
 		 339 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  81.42 
 
 		 339 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  78.93 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  62.5 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  63.64 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  63.64 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  63.64 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  63.64 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  63.36 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  63.42 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  63.42 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  55.91 
 
 		 362 aa  328  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 370 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.78 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  31.75 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  31.12 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.08 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  30.36 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  30.89 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  30.97 
 
 		 360 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  31.63 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  28.65 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.98 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  31.23 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  31.23 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.52 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.17 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  27.67 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  27.55 
 
 		 323 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  25.41 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  25.56 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  26.07 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  27.14 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.25 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25.15 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.64 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  28.12 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  26.05 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  28.06 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.03 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  28.06 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.82 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  25.55 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  28.79 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.9 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  28.2 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  26.59 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.31 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.31 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.31 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.31 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.31 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.31 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  28.31 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  28.01 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.71 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  24.24 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  25.23 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  24.29 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  28.1 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  26.46 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  26.41 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  33.12 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  28.71 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  45.33 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  25.62 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  25.7 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.12 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.12 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  24.27 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  20.65 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  24.49 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  32.57 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  38.18 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  38.18 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  23.67 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  41.18 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.28 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  23.06 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  42.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  23 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  30.86 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>