160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2193 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  751    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  28.49 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  28.79 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  27.99 
 
 		 336 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  28.28 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  27.41 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  27.41 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  27.42 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  29.02 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  25.37 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.86 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.14 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  28.68 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  27.27 
 
 		 334 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  27.43 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  26.69 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  28.21 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  27.14 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  29.15 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  26.24 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  28.21 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.86 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.86 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.86 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.86 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.86 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.86 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  25.45 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  29.15 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  27.07 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.35 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.54 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  25.84 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  24.05 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.52 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  22.63 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  25.22 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  26.36 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  22.91 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  25.28 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.65 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.49 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.3 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  23.81 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  23.26 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  23.74 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  40 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1167  hypothetical protein  42.19 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  24.44 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.4 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.4 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  39.24 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  22.09 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  24.42 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  32.18 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.9 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.9 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  36.11 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  32.18 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  34.31 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  25.9 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.87 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  37.36 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  24.17 
 
 		 189 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  24.17 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  38.81 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  38.81 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  38.81 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  38.81 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  38.81 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  38.81 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  38.81 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 325 aa  53.5  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  29.58 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  23.43 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  35.45 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  23.24 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  42.03 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36.92 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  27.21 
 
 		 281 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  41.38 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30 
 
 		 340 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  29.73 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  29.81 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>