186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1384 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  100 
 
 		 324 aa  663    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  28.84 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  27.76 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  29.45 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  44.58 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  52.24 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  53.03 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  50.75 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  24 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  36 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  45 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  48.48 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  48.48 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  48.48 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  48.48 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  45 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  46.97 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  43.28 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  46.97 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  24.03 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  40.24 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  44.12 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  40.45 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  39.71 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  45.9 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  34.33 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  21.52 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  40.98 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  44.26 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  44.26 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  38.46 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  44.26 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  43.33 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  40.28 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  37.33 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  30.69 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  40.85 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  35 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  42.62 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  33.75 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  34.29 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  42.62 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  39.39 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36.51 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  35.71 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  35.29 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  37.7 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  32.5 
 
 		 165 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  39.39 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  36.36 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  40.98 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  34.92 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  34.92 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  43.33 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  34.92 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  34.92 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  34.92 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  34.92 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  34.92 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  33.8 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  37.88 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  37.7 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  34.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 196 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  35.82 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>