134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2004 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 297 aa  600  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  47.4 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  37.46 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  37.26 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  40.45 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  26.02 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  20.69 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  24.04 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  27.01 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  38.82 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.83 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  24.22 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  34.83 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  24 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  30 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  25.09 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  31.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  26.9 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  24.66 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  39.51 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.73 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  34.18 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  26.09 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.35 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  33.75 
 
 		 404 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  23.18 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  25.24 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40.32 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  30.38 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  23.46 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  34.85 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  23.46 
 
 		 362 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  23.46 
 
 		 360 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  23.46 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  23.46 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  23.46 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  23.46 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  23.46 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  28 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  32.84 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  25.27 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  31.4 
 
 		 566 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  37.14 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  23.27 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  26.95 
 
 		 130 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  26.95 
 
 		 130 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  32.86 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  32.86 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  28.77 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  32.86 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  28.77 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  36.07 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  32 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  35 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.61 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  31.43 
 
 		 374 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  29.9 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  36.07 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  25.22 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  29.73 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.71 
 
 		 281 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  39.68 
 
 		 511 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  36.21 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  30.99 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  26.51 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>