50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2178 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  36.66 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  49.33 
 
 		 232 aa  89.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  45.78 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  23.38 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  29.23 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  21.55 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  21.92 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  34.78 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  27.91 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  35.29 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  27.91 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  28.46 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.77 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  27.91 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  22.79 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  28.92 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  26.36 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 114 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.83 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  26.97 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  26.45 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  37.66 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  37.66 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  37.68 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  37.66 
 
 		 374 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  31.34 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  22.7 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  19.7 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  33.85 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  29.17 
 
 		 566 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  20.16 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 450 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  30.53 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>