210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3112 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  36 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  30.24 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  30.08 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  28.42 
 
 		 256 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  32.71 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  26.12 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  23.68 
 
 		 368 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  27.44 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  25.65 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  23.96 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  26.18 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  25.74 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  26.76 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.29 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  47.89 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  43.53 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  41.57 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  34.26 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  23.37 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  25.7 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  47.83 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  49.28 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  49.28 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  49.28 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  41.67 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  45.9 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  45.9 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  47.83 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  47.83 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  21.51 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  45.9 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  43.94 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  49.25 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  38.96 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  46.27 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  42.42 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  49.21 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  42.65 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  39.29 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  28.83 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  21.77 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  37.84 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  31.18 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  40.3 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  28.86 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  39.44 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  24.44 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  36.9 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  32.56 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  41.38 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  41.94 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  32.95 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  23.05 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  27.66 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  44.12 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  25.66 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.98 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  32.29 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  41.67 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  20.59 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  30.49 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  36.05 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  23.75 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2890  response regulator receiver protein  56.25 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0671992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  41.94 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  25.14 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.3 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  24.48 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  20.43 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.74 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  36.11 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  36.51 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  24.11 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  21.55 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>