209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1282 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  90.98 
 
 		 265 aa  474  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  47.75 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  30.43 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  24.43 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  28.46 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  34.07 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  28.15 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.03 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  24.55 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  25.74 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  29.11 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  47.95 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  47.95 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  44 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  28.01 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  29.2 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  25.53 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  34.9 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.19 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  24.21 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.94 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.94 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  46.38 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  46.38 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  45.21 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  43.84 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  26.39 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  45.71 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  26.39 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.65 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  43.84 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  36.51 
 
 		 510 aa  72  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  29.13 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  24.6 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  42.47 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  42.47 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  39.17 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  42.47 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  42.86 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  41.1 
 
 		 372 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  38.89 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  22.73 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  35.06 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  27.04 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  36.67 
 
 		 566 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  23.68 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  25.4 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  26.64 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  32.62 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  50.75 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  25.8 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.52 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  37.93 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  25.19 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  26.62 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  42.42 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  44.19 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  46.15 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  46.15 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  48.28 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  41.79 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  40.85 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  43.06 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  34.83 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  38.55 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  42.17 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  39.44 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  24.82 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  33.86 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  22.52 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  39.71 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  30.43 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  38.71 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>