205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1185 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  63.76 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  41.41 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  39.8 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  39.8 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  39.46 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  39.8 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  39.8 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  40.07 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  40.33 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  40.34 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  39.47 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  44.2 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  39.86 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  28.68 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  37.72 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  27.15 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 270 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  34.65 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  52.24 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  41.18 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  23.42 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  22.34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  24.65 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.24 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  22.9 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  27.17 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  22.22 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.71 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  26.69 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  31.88 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  20.35 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  23.7 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  33.12 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  41.89 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  24.91 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  26.61 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  42.03 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  30.08 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  35.96 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  22.34 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.99 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  24.4 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  30.22 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  40.28 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  41.54 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  35.06 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  35.71 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.35 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  31.82 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  29.63 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.78 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  30.28 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.78 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  36.99 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  34.67 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  34.62 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  34.67 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  25.55 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  31.43 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  28.37 
 
 		 188 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  26.96 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  38.71 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04591  hypothetical protein  31.06 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  34.62 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1315  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  30.56 
 
 		 566 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  22.84 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  22.91 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>