More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3162 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  100 
 
 		 450 aa  879    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2890  response regulator receiver protein  72.41 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0671992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  39.94 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1315  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 343 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.1 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  36.23 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  34.42 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  39.42 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.11 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 231 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.66 
 
 		 239 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 243 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 235 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 243 aa  72  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.66 
 
 		 239 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  36.89 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  32 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  36.89 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0969  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.91 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  35.76 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  38.02 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  36.09 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0899  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.932074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  34.42 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  36.07 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  36.03 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  32.24 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  36.36 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  33.83 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  31.85 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  34.06 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  34.71 
 
 		 237 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  34.68 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.25 
 
 		 229 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0584  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  35.38 
 
 		 233 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 237 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  36.42 
 
 		 216 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0538  sensory transduction regulator  32.2 
 
 		 222 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  31.21 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.25 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.8 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0358  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0923  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  32.8 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.21 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  40.94 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  31.21 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  29.91 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  32.59 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>