More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0538 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0538  sensory transduction regulator  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0403  transcriptional activator protein CopR  59.41 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1559  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.204072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1873  response regulator receiver  48.31 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0969  DNA-binding response regulator  46.98 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0899  DNA-binding response regulator  46.98 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.932074  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0923  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0802  two-component response regulator  41.94 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.289685  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  34.82 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  34.82 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.04 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.8 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1105  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  35.91 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  32.74 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.33 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1020  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.53 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 242 aa  134  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  33.48 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  35.06 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  35.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2257  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512842  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  31.86 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  33.33 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  33.18 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>