More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1559 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1559  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.204072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1873  response regulator receiver  63.41 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0403  transcriptional activator protein CopR  52.2 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0538  sensory transduction regulator  48.21 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0899  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.932074  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0969  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0802  two-component response regulator  42.6 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.289685  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0923  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  41.28 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  39.74 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.5 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  36.28 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.5 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 256 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  37.5 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 272 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.5 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  38.63 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  35.43 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.81 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.27 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 238 aa  134  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  36.16 
 
 		 241 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 250 aa  134  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  38.33 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  35 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0705  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>