33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2366 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  37.85 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  55.17 
 
 		 232 aa  99.4  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  23.08 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  24.91 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  21.8 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  36.84 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.75 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  24.2 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  27.57 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 260 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  23.1 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.92 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  24.02 
 
 		 566 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  22.56 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  35.56 
 
 		 375 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  35.56 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  35.56 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  36.84 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.16 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  24.65 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  38.71 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  18.92 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  22.64 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  32.86 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>