247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1056 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  26.52 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  28.63 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  26.59 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  47.83 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  50 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  21.48 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  24.54 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  28.69 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  39.84 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  30.6 
 
 		 333 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  23.81 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  23.38 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  52.24 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  46.38 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.7 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  40.96 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  44.74 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  44.74 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  41.98 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  23.61 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  34.68 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  34.68 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  38.58 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  30.37 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  29.33 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  44 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.3 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.37 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.37 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  44.78 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  43.66 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  33.79 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 326 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  43.28 
 
 		 324 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 312 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  25.75 
 
 		 405 aa  62  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  28.74 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  31.3 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  35 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  42.03 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  47.76 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  39.71 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  39.13 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  26.95 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  23.6 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  29.05 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  30.3 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  39.39 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  44.26 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.76 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  44.62 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  46.97 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  27.52 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  24.28 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  28.46 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  31.5 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  27.65 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  24.73 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  24.73 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  24.58 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  40.85 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  45.9 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  43.33 
 
 		 511 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  28.67 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  31.31 
 
 		 360 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>