89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1934 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  975    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  45.32 
 
 		 406 aa  329  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  44.77 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  43.84 
 
 		 399 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  41.48 
 
 		 405 aa  296  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  45.93 
 
 		 375 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 409 aa  266  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.89 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  23.17 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  35.35 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  38.36 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  35.48 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  29.24 
 
 		 312 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  30.3 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  30.3 
 
 		 380 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  39.44 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 249 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  29.29 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 260 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  31 
 
 		 356 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  31 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  31 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  31 
 
 		 356 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  31.52 
 
 		 331 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  37.14 
 
 		 321 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  22.45 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  29.29 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  37.5 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  29.55 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  34.38 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  47  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  24.26 
 
 		 263 aa  47  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  32 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  24.26 
 
 		 210 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  31.08 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  32.31 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  28.77 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  33.78 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  31.75 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  32.88 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  34.15 
 
 		 245 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  34.92 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.74 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  30.99 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  31.75 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  31.03 
 
 		 285 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  37.23 
 
 		 362 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  33.78 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  35.71 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  35.71 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  37.23 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  35.71 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 199 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  30.43 
 
 		 334 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  25.33 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.19 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  31.75 
 
 		 310 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 279 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  31.15 
 
 		 340 aa  44.3  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.99 
 
 		 251 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  31.88 
 
 		 281 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 285 aa  43.9  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 370 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  29.21 
 
 		 284 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 322 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  25 
 
 		 130 aa  43.5  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 342 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  36.07 
 
 		 151 aa  43.5  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>