148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1623 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  766    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  31.3 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  50.66 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 501 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  38.24 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  39.44 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  42.86 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  42.86 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.43 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  41.27 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  39.68 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  37.18 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  40.98 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  38.16 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  40.98 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  40.98 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  40.98 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  35.29 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  35.29 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  42.03 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  39.44 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  37.84 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  35.23 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.36 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  39.73 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  43.28 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 326 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  36.92 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  38.46 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 196 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  35.21 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  34.18 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  33.8 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  35.29 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  37.33 
 
 		 273 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  31.76 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  41.67 
 
 		 510 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  31.51 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  35.06 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  34.29 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  30.69 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  35.94 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.09 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  32.11 
 
 		 281 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  35.06 
 
 		 266 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 339 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 		 277 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  38.33 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  37.29 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  32.14 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  30.99 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  37.68 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  36 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  35.48 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  32.93 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  32.39 
 
 		 251 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  35.38 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  40.98 
 
 		 333 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  34.25 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  32.35 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  32.35 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 335 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 130 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  27.4 
 
 		 189 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  35.48 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>