188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1011 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  830    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  45.52 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  39.72 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  41.22 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  30.67 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  33.07 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  45.95 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  44.59 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  32.81 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  44.59 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  44.59 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  44.59 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  31.93 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  44.59 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  29.96 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  44.59 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  44.59 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  32.19 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.79 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  36.59 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  45.45 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 314 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  41.18 
 
 		 331 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  40.58 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  39 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  39.13 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  28.91 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  26.81 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  26.81 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  36.42 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  38.89 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25.71 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  34.34 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  22.63 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  35.14 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  30.2 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.36 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  41.79 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  38.53 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  38.24 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  29.27 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  37.66 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  46.97 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  23.97 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  30.88 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  33.63 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  22.3 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  36.36 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  43.84 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30.88 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.03 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  37.5 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  37.5 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  44.44 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  38.24 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  35 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  29.77 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  28.24 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  30.87 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  44.44 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  38.57 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  29.27 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  42.62 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  35.62 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  28.24 
 
 		 303 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  28.24 
 
 		 303 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  38.36 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  31.36 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.18 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  28.46 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>