227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1932 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 326 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  29.81 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  30.95 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.48 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25.64 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  25.48 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  28.28 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.97 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  28.57 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  30.42 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  29.28 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.21 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  26.85 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.68 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  26.94 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.15 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  27.86 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  25.99 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  26.46 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  25.85 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  27.2 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.49 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  26.51 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  26.41 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  25.85 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  25.85 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.21 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  28.15 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  25.85 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  25.85 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  25.85 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  25.85 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  25.85 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  34.38 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  26.89 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  38.84 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  33.85 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  34.62 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  24.65 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  35.16 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.47 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.47 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  24.37 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  26.6 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  33.08 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  33.85 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  33.85 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  33.08 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  33.08 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  33.08 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  33.09 
 
 		 436 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  45.59 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  45.59 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  26.51 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  41.98 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  40.45 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25.29 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  31.4 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  46.97 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.55 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  23.86 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.71 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  40 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  30.16 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  34.19 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  25.93 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  40 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  30.16 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  30.82 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  45.95 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  21.9 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  37.08 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  37.08 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>