64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0746 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  955    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  46.77 
 
 		 374 aa  116  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  39.72 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  35 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.85 
 
 		 2449 aa  80.1  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 279 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  37.96 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  35.82 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 312 aa  67  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  37.14 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  40.85 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.61 
 
 		 3521 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.56 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 273 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  39.05 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  31.13 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  39.44 
 
 		 271 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  32.48 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  32.48 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  27.75 
 
 		 3472 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  27.75 
 
 		 3471 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  45.45 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  36.05 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  38.14 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.93 
 
 		 1888 aa  58.9  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  27.04 
 
 		 3409 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  31.85 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  32.93 
 
 		 347 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  57  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  32.93 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 287 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  33.9 
 
 		 293 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  32.12 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  33.61 
 
 		 314 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  43.94 
 
 		 314 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 260 aa  53.5  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 307 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  34.48 
 
 		 368 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  24.36 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  38.04 
 
 		 360 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  36.28 
 
 		 360 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  36.96 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  36.96 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  36.96 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  36.96 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  36.96 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  36.96 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  32.14 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  34.72 
 
 		 342 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 736 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>