142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3604 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 278 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  44.29 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  36.96 
 
 		 284 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  30.45 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  46.15 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  29.46 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  26.34 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  22.52 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  22.61 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  27.53 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  28.47 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.9 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  43.53 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  25.52 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  26.24 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  32.77 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  45.45 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  28.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  41.94 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  43.94 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  30.95 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  40.85 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  27.72 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  44.12 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  37.84 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  40.54 
 
 		 511 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  31.68 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  30.14 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  30.77 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  30.29 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  30.29 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.39 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  38.46 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  35.16 
 
 		 436 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  22.31 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  31.06 
 
 		 372 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  42.62 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  42.37 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  22.18 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  39.06 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  35.9 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  39.39 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  35.96 
 
 		 151 aa  49.3  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  39.68 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.38 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  41.79 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  38.46 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  33.85 
 
 		 566 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  38.98 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  22.76 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  26.02 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.65 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  22.76 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  34.38 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  34.38 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  37.29 
 
 		 448 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  34.33 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  34 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  34 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>