206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1608 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 270 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  50.37 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  31.34 
 
 		 256 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  32.21 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.12 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  26.77 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  27.64 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.96 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  26.37 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  28.17 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  27.82 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  25.1 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  26.1 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  27.76 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  24.45 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  24.81 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  20.08 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  27.82 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  25.24 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  27.59 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  27.59 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  24.82 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  26.77 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  36.05 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  24.03 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 352 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  27.81 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  43.06 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  42.65 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  47.22 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  42.65 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  35.37 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  45.45 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  35.16 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  32.74 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  23.66 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  29.28 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  32.74 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  27.48 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  53.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  35.82 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  43.84 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  53.23 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  28.15 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  49.28 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  41.89 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  37.33 
 
 		 340 aa  62  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  39.73 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  33.06 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  33.06 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  49.23 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  51.61 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  36 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  25.38 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  21.65 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  28.26 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  39.73 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  39.44 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.32 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  39.73 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  37.31 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  37.84 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  37.35 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  32.53 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1315  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  30.82 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  32.53 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>