229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1468 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 312 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  30.24 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  28.53 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  50 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  26.19 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  46.38 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  39.56 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  50.75 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  50 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  50.75 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  24.1 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  48.57 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  48.57 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  48.57 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  48.57 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  48.57 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  48.57 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  48.57 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  21.16 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  49.28 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  45.71 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  48.57 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  51.43 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  54.29 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  39.47 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  46.38 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  46.48 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  35.92 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  42.25 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  56.9 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  48.48 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  47.62 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  31.43 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.24 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  44.29 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  38.57 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  40.51 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.34 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  44.93 
 
 		 448 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  42.25 
 
 		 566 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  38.3 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  25.34 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  21.85 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 130 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 130 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  44.93 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  21.35 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  41.89 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  23.38 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  26.05 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  40.85 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  43.04 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  40.58 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  23.25 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  44.78 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  39.71 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  40.51 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  22.19 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  40.58 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  39.68 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  35.29 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  42.25 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  35.29 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  41.94 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  39.71 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  41.77 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  37.5 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  36.25 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  35.48 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  40.28 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  41.43 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  23.92 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  38.57 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  42.03 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  37.5 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  37.04 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>