More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3643 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
511 aa  1023    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1904  ATP-binding protein  40.97 
 
 
332 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1975  ATP-binding protein  42.12 
 
 
330 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2060  ATP-binding protein  41.58 
 
 
330 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1955  ATP-binding protein  39.53 
 
 
328 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3238  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
316 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0363  ATP-binding protein  27.02 
 
 
380 aa  126  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1397  flagellar synthesis regulator FleN, putative  26 
 
 
388 aa  114  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0750  ATP-binding protein  24.83 
 
 
323 aa  108  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.18 
 
 
284 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  25.72 
 
 
304 aa  94.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 
298 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  23.41 
 
 
295 aa  89  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3239  heat shock protein DnaJ domain protein  32.62 
 
 
179 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.13 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.28 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.62 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  22.12 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  22.12 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.07 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.85 
 
 
270 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.86 
 
 
271 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  25.6 
 
 
271 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  21.78 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.62 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.34 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.58 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.2 
 
 
297 aa  79.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  29.3 
 
 
300 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.4 
 
 
287 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.92 
 
 
290 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.37 
 
 
293 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
333 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.5 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  28.57 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.43 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.26 
 
 
370 aa  77  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.79 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 
283 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.17 
 
 
276 aa  75.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  24.32 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  19.64 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.9 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  31.82 
 
 
266 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  30.98 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  28.4 
 
 
260 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.32 
 
 
311 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  26.52 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  25.26 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.04 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.54 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  45.57 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  45.57 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  31.32 
 
 
265 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  31.32 
 
 
265 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.99 
 
 
301 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  39.31 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  21.05 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  33.76 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0679  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
266 aa  67  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 
257 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
296 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 
296 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
249 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  37.58 
 
 
443 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  38.62 
 
 
497 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  33.33 
 
 
264 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
342 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 
274 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  30.95 
 
 
266 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  30.77 
 
 
287 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  42.65 
 
 
345 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  32.48 
 
 
267 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  29.45 
 
 
353 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  29.45 
 
 
353 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  45.45 
 
 
284 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  24.73 
 
 
274 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 
277 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  32.9 
 
 
264 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
296 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  31.85 
 
 
266 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.36 
 
 
276 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 
246 aa  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.51 
 
 
270 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 
295 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.82 
 
 
343 aa  63.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  24.36 
 
 
277 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.36 
 
 
277 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 
277 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 
266 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.47 
 
 
295 aa  63.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
291 aa  63.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>