64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3239 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3239  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  32.62 
 
 		 511 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  39.76 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  38.37 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  40.54 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.19 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  31.94 
 
 		 271 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  32.35 
 
 		 245 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  35.29 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 267 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  35.29 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  32.05 
 
 		 436 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 241 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  34.78 
 
 		 448 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  29.11 
 
 		 441 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  31.71 
 
 		 565 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  39.22 
 
 		 281 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.88 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 277 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  27.85 
 
 		 307 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  35.14 
 
 		 404 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  29.41 
 
 		 340 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  29.73 
 
 		 324 aa  45.1  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  27.54 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 276 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  34.25 
 
 		 266 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 273 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  31.51 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  33.78 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  31.34 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  28.42 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  33.82 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  32.43 
 
 		 280 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 297 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  30.65 
 
 		 288 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  34.38 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  27.94 
 
 		 348 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  27.94 
 
 		 347 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  36.23 
 
 		 378 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  32 
 
 		 374 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 265 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 270 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  33.85 
 
 		 323 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  31.94 
 
 		 271 aa  42  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  29.27 
 
 		 286 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  29.27 
 
 		 286 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  36.23 
 
 		 310 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  31.94 
 
 		 273 aa  41.6  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  31.25 
 
 		 304 aa  41.2  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  32.35 
 
 		 372 aa  41.2  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 298 aa  41.2  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  35.09 
 
 		 293 aa  40.8  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>