134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1666 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  26.27 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  37.65 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.19 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  39.73 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30.89 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  43.08 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  37.35 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.89 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  38.67 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  37.18 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  33.75 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  25.18 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  37.31 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  40.24 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  33.71 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  37 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  26.14 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  36.49 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  31.46 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  36.78 
 
 		 511 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  40.28 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  40.58 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  37.7 
 
 		 364 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  30.34 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  34.78 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.11 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  30.34 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  34.67 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  33.78 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  32.89 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  37.68 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  38.57 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  32.5 
 
 		 372 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  31.94 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  35.21 
 
 		 374 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 325 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  29.73 
 
 		 566 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  27.66 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  30.99 
 
 		 347 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  32.35 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30.99 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  32.35 
 
 		 368 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  23.47 
 
 		 314 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  32.35 
 
 		 363 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  33.85 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 351 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  43.33 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  29.85 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  33.85 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  31.34 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  34.78 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  34.33 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  37.31 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  32.81 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  32.31 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  30 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  30 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  37.31 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  30.88 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  30.88 
 
 		 334 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  30.88 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  30.88 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.68 
 
 		 331 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  32.53 
 
 		 436 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  30.88 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  30.95 
 
 		 292 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  29.85 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  30.59 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  35.59 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3239  heat shock protein DnaJ domain protein  32.43 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  29.85 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>