158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1500 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  38.29 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  31.29 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  34.66 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  29.48 
 
 		 243 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  58.9 
 
 		 565 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  56.76 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  24.04 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  21.91 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.77 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.77 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  24.48 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  45.21 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  35.85 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  31.54 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  24.44 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  31.54 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  22.31 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  28.73 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  22.76 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  26.84 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.04 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  24.36 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.65 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  39.47 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  21.43 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  25.56 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  23.51 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  23.23 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  36.9 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  38.89 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  30.06 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  30.06 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  23.79 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  34.25 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  22.07 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  29.15 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  46.38 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  33.09 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  32.03 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  32.03 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  40 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  23.67 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  23.53 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  35 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  23.24 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  36.11 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  36.11 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  26.28 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  31.63 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  25.9 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.11 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  20.72 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  27.67 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  39.44 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  32.03 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  23.45 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  30.77 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  25.26 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  36.23 
 
 		 361 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  32.03 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.9 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  29.66 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  26.07 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  30.11 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 352 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  36.23 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  36.92 
 
 		 376 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  36.92 
 
 		 375 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  24.09 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  39.71 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  39.39 
 
 		 448 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  40.28 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  35.38 
 
 		 374 aa  52.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 369 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  22.85 
 
 		 362 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  22.99 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  35.38 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  35.38 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  35.38 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  35.38 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  37.88 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.75 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  30.83 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>