152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1778 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  98.61 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  58.93 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  58.93 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  50.53 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  25.76 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  26.26 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  27.92 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  25.88 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  26.13 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.13 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  25.83 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.23 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.84 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  25.82 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  25.73 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  26.25 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  25.37 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  24.71 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  26.33 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  26.33 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  26.33 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  24.53 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  26.33 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  26.33 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  26.33 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  26.33 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.74 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  29.03 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25.5 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.71 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  38.82 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.41 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  43.48 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  43.48 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  22.04 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  21.61 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  26.86 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  34 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  22.46 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  22.18 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  34.21 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  25.2 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  25.2 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  25.2 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  31.9 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  31.9 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  29.15 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  31.9 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  28.04 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  22.82 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  23.79 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  19.18 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  26.3 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.93 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  27.96 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  35 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  40 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  24.7 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  35.82 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  38.57 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  35.82 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  22.68 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  34.33 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  28.24 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  21.72 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  36.76 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  21.31 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  24.31 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  35.06 
 
 		 448 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  27.73 
 
 		 189 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  28.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  28.17 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  21.43 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  20.74 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  35.82 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  36.25 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  34.33 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  33.85 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>