183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1659 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  55.89 
 
 		 286 aa  321  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  55.89 
 
 		 286 aa  321  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  52.28 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  52.28 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.38 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  27.47 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  27.15 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  27.86 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  28.81 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  24.24 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  27.3 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  25.77 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  26.92 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  25.47 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  24.69 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  26.71 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.17 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.71 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  26.62 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  24.44 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.09 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  30.04 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.46 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  25.47 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  23.51 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  22.66 
 
 		 393 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  26.61 
 
 		 248 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  24.57 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  24.36 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  21.04 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.03 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.79 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  27.2 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  23.1 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  20.73 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  36.92 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  26.52 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  25.38 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  26.74 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  44.78 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  44.87 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  44.87 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  44.87 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  29.22 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  27.15 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  29.22 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  29.22 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  26.01 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  17.18 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  25.39 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  41.79 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  23.95 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  19.4 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  27.92 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  23.55 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  29.93 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  35 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  29.93 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  43.08 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  42.03 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  38.81 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  25.29 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  41.54 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  40 
 
 		 347 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  35.37 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.08 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  38.57 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  34.12 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  35.82 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>