211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2542 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 362 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  83.78 
 
 		 370 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 342 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  55.1 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  55.1 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  55.65 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  57.21 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  57.21 
 
 		 387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  57.21 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  57.21 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  57.21 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.91 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  29.62 
 
 		 321 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  28.7 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  28.88 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.07 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  26.04 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  27.89 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  30.37 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  28.53 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  26.51 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  26.15 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  27.37 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  27.66 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.79 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.79 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25.36 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  27.66 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  27.35 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  26.28 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.14 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  26.28 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  26.45 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  25.45 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  27.36 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  27.04 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  25.45 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  25.45 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  25.45 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  25.45 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  25.45 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  26.92 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  25.45 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  25.26 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  25.45 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.16 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  24 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  24 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  26.46 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  27.19 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  37.39 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  26.81 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  26.05 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  28.78 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  26.58 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  26.27 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  26.91 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  43.02 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  22 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  22.93 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  25.39 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  29.21 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  23.92 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  27.41 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  26.38 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  43.94 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  22.49 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  23.87 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  41.67 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.57 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.43 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  21.71 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  28.53 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  25.08 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  25.08 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  35.24 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  22.43 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  38.96 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  27.96 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>