129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1423 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  600  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  48.02 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  50.16 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  46.84 
 
 		 290 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  43.33 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  43.24 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  38.51 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  39.81 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  38.37 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  32.23 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  32.23 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25.85 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  52 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.79 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  38.53 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  29.21 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.96 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  30.87 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  30.9 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  23.66 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  20.68 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  23.89 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  43.14 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  28.04 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  24.43 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  23.84 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  30.77 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  24.53 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  21.73 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.71 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  22.91 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  23.48 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  25.99 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  23.41 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  23.12 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.66 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  23.41 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  23.42 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  34.06 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  23.05 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  32.04 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  25.56 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  22.98 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  23.7 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  33.93 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  21.7 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  21.67 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  22.22 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  21.7 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  24.08 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  22.41 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  23.26 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.01 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  35.14 
 
 		 165 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  36.11 
 
 		 165 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  24.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  41.77 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  41.77 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  41.77 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  41.77 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  41.77 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  41.77 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  41.77 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  32.32 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  32.31 
 
 		 163 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  40.28 
 
 		 360 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  27.37 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  32.31 
 
 		 188 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  32.58 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  39.29 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  34.33 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  28.83 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  22.39 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  35.71 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  32.99 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  22.15 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  23.29 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  21.62 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  33.85 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>