221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2078 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  63.76 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  40.4 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  40.4 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  39.73 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  39.73 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  39.26 
 
 		 304 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  38.74 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  38.74 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  37.79 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  38.05 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  46.51 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  38.19 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  37.07 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  28.93 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25.44 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  24.73 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  26.24 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  36.64 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  44.58 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  26.39 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  23.43 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  24.24 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  44.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  25.18 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  22.42 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  24.82 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  26.78 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  21.5 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  43.24 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  22.9 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  28.78 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  39.73 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  43.48 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  26.21 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.36 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  37.18 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  26.21 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  24.06 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  40.28 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  41.54 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  22.71 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  28.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  35.62 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  35.8 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  25.89 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  32.54 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  36 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  35.62 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  37.5 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  22.93 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  31.94 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  24.16 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.08 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  34.72 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  31.91 
 
 		 347 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  31.91 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  57  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  24.4 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  27.19 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  30.69 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  39.66 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  23.44 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  28.8 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.03 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  34.62 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  22.99 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  32.53 
 
 		 382 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  23.19 
 
 		 166 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>