203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2853 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  27.22 
 
 		 393 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.78 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  29.59 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  29.26 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  29.26 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  29.21 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  28.73 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  29.04 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  29.71 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  28.02 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  27.3 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  29.25 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  28.73 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  29.25 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30.2 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.97 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.97 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.97 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.97 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.97 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  28.97 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  27.22 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  27.79 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  27.84 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  28.86 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  26.82 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  25.88 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  28.93 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  26.37 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.55 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  26.41 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  27.51 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  25.4 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.8 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  25.38 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.23 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  40.8 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  30.27 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  26.13 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25.66 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  27.43 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.36 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  25.42 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.7 
 
 		 324 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.34 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.34 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  26.06 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  25.98 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  41.32 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  25.67 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  26.05 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  26.72 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  23.82 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  36.43 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  44.87 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 196 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.51 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.51 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  25.13 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  25.13 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  35.34 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  22.88 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  37.89 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  40.4 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.18 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  35.23 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.33 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  30.4 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  25.73 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0734  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  27.35 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  38.24 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  36.76 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  35.21 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  37.18 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  34.78 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  30.83 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  28.68 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  37.5 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>