174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1421 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 369 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  63.66 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  52.3 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  51.74 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  54.13 
 
 		 387 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  54.13 
 
 		 387 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  54.13 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  54.13 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  54.13 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  56.85 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  56.85 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  60.89 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  60.89 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  63.13 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  32.15 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  29.52 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  29.1 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  27.47 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.6 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.2 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  28.45 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  31.44 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  25.96 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  25.2 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  24.8 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  25.34 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  25.34 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  27.76 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.65 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  28.53 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  28.61 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  23.28 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  25.6 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.3 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  27.19 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  28.24 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  26.98 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  24.73 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.31 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  24.78 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  27.33 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  26.82 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  39.62 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  41.67 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  25.8 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.78 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  25.53 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  24.72 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  25.07 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  26.19 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  26.19 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.24 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  26.19 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  26.19 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  26.19 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.93 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  26.74 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  26.19 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  26.19 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  24.4 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  28.36 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  41.1 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.85 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  25.76 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  38.64 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  41.1 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  19.09 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  25.29 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  21.34 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  39.71 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  35.71 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  39.71 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  32.81 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  39.71 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  21.31 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>