120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2234 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 301 aa  603  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  46.36 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  36.72 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  37.85 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  48.91 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  37.25 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  25.69 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  24.92 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  24.75 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  25.35 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  28.12 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  31.43 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  34.07 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  43.94 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  34.29 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  32.86 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  28.15 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  32.14 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  32.14 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  45.45 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  32.14 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  32.14 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  32.14 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  38.57 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  25.18 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  22.38 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  20.43 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  29.05 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  30.23 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  41.79 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  37.5 
 
 		 566 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  37.63 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  36.36 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  30.14 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  39.77 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  37.5 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  34.15 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  25.45 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  28.77 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  28.77 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  28.77 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  28.77 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  34.88 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  34.78 
 
 		 436 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 241 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 362 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  32.91 
 
 		 374 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  23.3 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  38.1 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  41.38 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  35.44 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  33.82 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  32.81 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.2 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  31.65 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2463  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.495318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  39.66 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  31.65 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  31.65 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.03 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1368  helix-turn-helix domain-containing protein  28.03 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0112601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 130 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  41.38 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  42.37 
 
 		 151 aa  46.2  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  27.72 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  41.38 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  28.06 
 
 		 404 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  29.03 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>